Equipe E1 Evolution et Développement des Chordés

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Notre équipe s’intéresse à l’évolution de la morphologie au cours de la transition chordés non-vertébrés/vertébrés. Cette transition est un bon modèle d’étude de l’évolution des mécanismes développementaux pour trois raisons : i) deux duplications complètes du génome ont eu lieu au cours de cette transition entraînant une expansion du nombre de gènes chez les vertébrés, ii) nous avons accès à un animal chordé non vertébré qui s’avère être un modèle de choix pour des études comparatives, et iii) de nombreuses études existent sur les mécanismes moléculaires contrôlant le développement embryonnaire chez les vertébrés.

L’animal modèle que nous utilisons est l’amphioxus, un céphalochordé, représentant la lignée de chordé ayant divergé le plus précocement. Il a conservé toutes les caractéristiques morphologiques définitoires des chordés (tube nerveux dorsal creux, notochorde dorsale, fentes pharyngiennes, etc.) mais reste un organisme très « simple » d’un point de vue aussi bien anatomique que génomique.

Au sein de notre équipe nous avons développé une méthode permettant d’induire l’émission de gamètes quotidiennement au cours de la saison de ponte de l’amphioxus, ainsi que les techniques basiques d’études du développement embryonnaire (HIS, immunolocalisations, traitements pharmacologiques, microinjection dans les œufs non fécondés, etc.). Nous avons aussi réalisé le séquençage complet ainsi que l’analyse de l’épigénome de l’amphioxus européen, Branchiostoma lanceolatum et avons développé les techniques de RNA-seq, ChIP-seq et ATAC-seq pour ce modèle. Additionnellement à la poursuite de l’acquisition de nouvelles connaissances concernant la biologie, la génomique et l’écologie de l’amphioxus, nous conduisons plusieurs projets de recherche concernant l’évolution de processus majeurs du développement embryonnaire tels la somitogenèse ou l’induction neurale.