Aller au contenu Aller au menu Aller à la recherche

accès rapides, services personnalisés
Rechercher
Biologie Intégrative des Organismes Marins
UMR 7232

Méthylation de l'ADN

Méthylation de l'ADN (séquençage bisulfite)

Objectif

Obtenir des statistiques sur le taux de méthylation des cytosines d'un génome.

Prérequis

Génome et annotations (format .fasta, format .gff3), reads DNA-Seq bisulfite (format .fastq).

Livrable

Un GFF du mapping bisulfite, un document Word présentant un bilan des analyses statistiques (méthylation des régions codantes et intergéniques).

Méthodes

- Bismark (mappings sur le génome)

- R (analyses statistiques).

08/02/21

Traductions :