Méthylation de l'ADN
Méthylation de l'ADN (séquençage bisulfite)
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Objectif |
Obtenir des statistiques sur le taux de méthylation des cytosines d'un génome. |
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Prérequis |
Génome et annotations (format .fasta, format .gff3), reads DNA-Seq bisulfite (format .fastq). |
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Livrable |
Un GFF du mapping bisulfite, un document Word présentant un bilan des analyses statistiques (méthylation des régions codantes et intergéniques). |
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Méthodes |
- Bismark (mappings sur le génome) - R (analyses statistiques). |